Kemiskinan relatif kebanyakan petani koko bermakna kesan alam sekitar seperti penebangan hutan dipandang remeh. Selama beberapa dekad, petani koko telah menceroboh hutan dara, kebanyakannya selepas penebangan pokok oleh syarikat pembalakan. Corak ini menurun apabila banyak kerajaan dan komuniti mula melindungi zon hutan yang masih ada. Secara umum, penggunaan baja kimia dan racun perosak oleh petani koko adalah terhad. Apabila harga biji koko tinggi, petani boleh melabur dalam tanaman mereka, yang membawa kepada hasil yang lebih tinggi yang pada seterusnya cenderung menghasilkan harga pasaran yang lebih rendah dan tempoh pelaburan yang lebih rendah.

Pengeluaran koko mungkin akan terjejas dalam pelbagai cara dengan kesan yang dijangka dari pemanasan global. Kebimbangan khusus telah dibangkitkan mengenai masa depannya sebagai tanaman kontan di Afrika Barat, pusat pengeluaran koko global sekarang. Jika suhu terus meningkat, Afrika Barat boleh menjadi tidak sesuai untuk menanam koko.[70][71]

Kacang koko juga mempunyai potensi untuk digunakan sebagai bahan tempat tidur lembu di ladang. Menggunakan sekam biji koko untuk tujuan itu mempunyai kesan yang baik terhadap kesihatan ambing (hasilnya kurang pertumbuhan bakteria) dan tahap ammonia (kurang tahap amonia di tempat tidur).[72]

Perhutanan tani

Biji koko boleh ditanam di bawah keadaan teduh, contohnya. perhutanan tani. Perhutanan tani dapat mengurangkan tekanan terhadap hutan terlindung sedia ada untuk sumber, seperti kayu bakar, dan melestarikan biodiversiti.[73] Perhutanan tani bertindak sebagai penampan untuk hutan yang dilindungi secara rasmi dan pulau biodiversiti dalam landskap yang terbuka dan dikuasai manusia. Penyelidikan terhadap kopi yang tumbuh di kawasan teduh telah menunjukkan bahawa perlindungan kanopi yang lebih besar di dalam plot sangat dikaitkan dengan kekayaan dan kelimpahan spesies mamalia yang lebih besar. Jumlah kepelbagaian dalam spesies pokok adalah agak setanding antara plot koko yang ditanam dan hutan primer. Peladang boleh menanam pelbagai jenis pokok teduh buah-buahan untuk menambah pendapatan mereka bagi menampung harga koko yang tidak menentu.[74] Walaupun koko telah disesuaikan untuk tumbuh di bawah kanopi hutan hujan yang tebal, perhutanan tani tidak lagi meningkatkan produktiviti koko dengan ketara.[75]